Привет. Можно так:
Код:

<script type="text/javascript">
	var quote=['Баннер один','Баннер два','Баннер три','четвертый рисунок','пятный рисунок','и т.д.'];
	document.write(quote[Math.floor(Math.random()*quote.length)]);
</script> 

В твоем случае нужен этот вариант, но обязательно запусти первый вариант что б понять принцип работы Код:

<script type="text/javascript">
	var quote=['1.jpg','ds.jpg','dsf.gif','sfs.jpg'];
	document.write('<img src='+quote[Math.floor(Math.random()*quote.length)]+' alt="banner">');
</script> 

Flash наврятле ты сюда вставишь. Нужно было в начале темы уточнять какие баннеры ты хочешь размещать.

Что касается ссылок, совсем забыл про них. Ну тогда так:
Код:

<script type="text/javascript">
	var quote=['<a href="/"><img src="рисунок"></a>','<a href="/"><img src="рисунок"></a>','<a href="/"><img src="рисунок"></a>','<a href="/"><img src="рисунок"></a>','<a href="/"><img src="рисунок"></a>','<a href="/"><img src="рисунок"></a>'];
	document.write(quote[Math.floor(Math.random()*quote.length)]);
</script>